还有关于卫所军队的调动，固然没有诸王的旨意驻扎在其封地的卫所军队不能随意调动，但是诸王旨意起作用的前提条件是要有皇帝颁布下来的诏书，这就意味着如果没有皇帝颁布的诏书，仅仅依靠诸王的旨意来调动卫所军队也是不可能的，即“有王令旨而无朝命，亦不擅发”。除此之外，驻扎在诸王封国之内的卫所军队还有一个作用就是钳制诸王，固然诸王的护卫军比任何一个卫所的军队都要多，但是在诸王的封国内并不是只有一个卫所，而是有着众多的卫所，这些卫所的军队加起来足可以取得对诸王军队的绝对优势，这也是朱元璋亲口承认的，即“王府置护卫，又设都司，正为彼此防闲”，就算皇子们野心作祟，手里区区数千到数万不等的军队也根本无力抗衡中央军。
还是要以燕王朱棣为例，“靖难之役”正式爆发前，被建文帝任命为北平都指挥使的谢贵事先接到建文帝的密旨，于是“以在城七卫并屯田军士布于城内，填溢街巷，追围王城外墙，又以木栅断端礼等四门”，可以说是把燕王府围了一个水泄不通，逼得燕王只能靠装疯卖傻来麻痹他们。这件事也反映出了朱元璋当初的设计是多么的巧妙，也表明了卫所军队的指挥权最终还是在朝廷手中掌握着。还有便是关于节制勋臣大将的问题，其实各地藩王能够节制勋臣大将的权力有无完全取决于皇帝的决定，皇帝让他们节制他们便能节制，皇帝不让他们节制，他们便节制不了。例如在洪武二十七年（公元1394年）的时候，朱元璋曾要求陕西都指挥使司训练将士，同时规定“北自延安、绥德，西自兰州，从魏国公徐辉祖等节制”，直接越过了当时驻扎在陕西境内的秦王、肃王、庆王三位王爷。由此可见，各地藩王所拥有的节制权也是不完整的。