法军攻城部队司令官卡尔托将军是写生画家出身，因为政治立场可靠，才被革命政府逐级晋升为旅长、师长，直至司令官。他不谙军机阵法，尤其对炮兵的运用和相关技术问题更是一窃不通，因而给拿破仑的指挥造成了诸多麻烦。他有时要求炮兵发炮烧几幢市区房屋，有时又要求炮兵漫无目的地轰击敌方炮台。有一回，卡尔托将军把拿破仑带到反法联军三座炮台之间的一处高地上，要求拿破仑赶筑一座炮垒，用以同时轰击敌方三座炮台。拿破仑反复说明，在敌方三座永久性炮台之间匆匆赶筑一座简单炮垒，不消一刻钟，就会被敌方三座炮台的交叉火力彻底摧毁，除了无谓牺牲炮手和大炮外，于法军攻城部队没有任何好处。又有一回，卡尔托将军指示在一栋石头建筑物前构筑炮垒，由于空间有限，大炮的后座力必然要撞碎石头，飞起的石片瓦砾将杀伤炮手。还有一回，卡尔托将军乘拿破仑不在场，以伤亡为由，下令撤下一个重要炮垒上的大炮。
拿破仑对卡尔托将军屡屡外行干预，哭笑不得，他多次拒绝了司令官的荒唐指示，并很正规地用文书请求卡尔托将军只下达总的指示，不要干预炮兵作战的技术问题。卡尔托将军的回答是，命令他用所有瞄准港口要塞区的大炮转向土伦城区，作三天饱和轰击，再令步兵纵队强攻港口要塞。拿破仑忍无可忍，只得写信给上级机关，陈述自己的见解，要求撤换卡尔托将军。不久，巴黎革命政府接受拿破仑的意见，调走卡尔托将军，另委派了一名新司令官。